Boér Gábor a 2015–2016-os idényben a csabaiak NB III-as gárdáját irányította, a 2016–2017-es kiírásban viszont már Zoran Szpisljak munkáját segítette asszisztensként az első csapatnál. 2017 márciusában megbízott vezetőedző lett, majd ezt követően véglegesítették. Boér Gábor a 2015–2016-os idényben a csabaiak NB III-as gárdáját irányította, a 2016–2017-es kiírásban viszont már Zoran Szpisljak munkáját segítette asszisztensként az első csapatnál. 2017 márciusában megbízott vezetőedző lett, majd ezt követően véglegesítették.
A 2017–2018-as NB II-es bajnokságban bronzéremig vezette a Békéscsabát, a mostani kiírásban pedig a hatodik helyen zárt az együttessel, ám Boér néhány hete már elmondta, hogy az idény végén távozik a klubtól, s máshol folytatja edzői karrierjét.
A találgatások most véget értek, az ETO FC Győr ugyanis a hivatalos honlapján bejelentette, hogy a következő szezontól Boér Gábor irányítja a másodosztályú csapatot – Boért követi Békéscsabáról asszisztense, Makra Zsolt is.
A győriek közlése szerint a két szakember egyaránt három évre írt alá.