Az 1958-as drafton Baylort első helyen választotta ki az akkor még Minneapolisban székelő Lakers, amelynek színeiben 14 idényt töltött el az NBA-ben. Baylort 1959-ben megválasztották az év újoncának, karrierje során 11-szer került be az All Star-keretbe és tízszer az év legjobbjaiból álló All-NBA csapatba. 1977 óta tagja a Hírességek Csarnokának.
Baylor edzőként öt éven át a New Orleans Jazznél dolgozott 1974 és 1979 között, majd 1986-tól 2008-ig a Los Angeles Clippers igazgatója volt.
Adam Silver, az NBA főigazgatója a liga honlapjának azt nyilatkozta, Elgin Baylor volt a liga egyik első szupersztárja.
Baylor csapata, a Lakers 1958 és 1971 között nyolcszor játszott nagydöntőt, ám egyszer sem győzött. Baylor ebből 7 fináléban lépett pályára. Az NBA történetében neki van a legtöbb nagydöntője bajnoki cím nélkül.
A Lakers-legenda az 1971–1972-es idény közben, mindössze kilenc mérkőzés után térdproblémái miatt bejelentette a visszavonulását. Hihetetlen, de igaz: a bejelentést követően a Lakers sorozatban 33 meccset nyert meg, ami a mai napig NBA-rekord. Ráadásul az évad végén a Los Angeles-i gárda bajnok lett, mivel a nagydöntőben legyőzte a New York Knickset.
A Lakers Baylornak is adott gyűrűt a bajnokság megnyerése után.
A basketball-reference.com adatai szerint Baylor NBA-pályafutása során meccsenként 27.36 pontot átlagolt. Nála csak Michael Jordannek (30.12) és Wilt Chamberlainnek (30.07) volt jobb mutatója.