Guardiola játékos-pályafutásának végén, a 2005–2006-os idényben szerepelt tíz mérkőzésen a mexikói Doradosnál, amelynek akkor a szintén spanyol Lillo volt a vezetőedzője.
Az 54 éves Lillo hazájának élvonalában a Real Sociedad és az Almería kispadján ült, majd dolgozott Kolumbiában és Japánban, legutóbb pedig a Qingdao Huanghait juttatta fel a kínai első osztályba.
Guardiola segítőjeként Mikel Artetát váltja, aki decemberben az Arsenal vezetőedzője lett.