Az olasz középhátvéd az Empoliban és a Juventusban nevelkedett, majd végül 2015 novemberében egy Sevilla elleni Bajnokok Ligája-mérkőzésen mutatkozhatott be a torinói csapat színeiben.
A 24 éves játékosnak 2021 nyarán járt volna le a szerződése a Juventusnál, ezt toldották meg két évvel, így most 2023. június végéig szól a kontraktusa.
Rugani ebben az idényben minden sorozatot figyelembe véve mindössze 14 mérkőzésen lépett pályára, ám a szerződéshosszabbítással egyértelművé vált, hogy hosszú távon számolnak vele, mivel a „zebrák” védelmének tengelye kiöregedőben van.