A 21. életévét éppen szerdán, augusztus 12-én betöltő középhátvédnek még 2019 végén kiugrott a válla, ami azóta is problémákat okozott neki. Miután a Juventus idénye a Lyon elleni Bajnokok Ligája-kieséssel véget ért, De Ligt a római Salvator Mundi Kórházban kés alá feküdt, ahol sikeres operáción esett át, viszont három hónapig, vagyis november közepéig így sem futballozhat.
De Ligt a 2019–2020-as évadban 39 tétmérkőzésen lépett pályára a Juvéban.