Nyugodtan nevezhetjük a Dinamo Zagrebet a magyar kupacsapatok mumusának. A zágrábiak még a jugoszláv időkben kiejtették a VVK-ból a Ferencvárost 3:1-es összesítéssel, s amióta Horvátország ismét függetlenné vált, rengeteg borsot törtek a magyar kupacsapatok orra alá.
1997 és 2019 között a Dinamo hat párharcot vívott magyar csapattal, mind a hatból továbbjutott, a már említett VVK-csatát is beszámítva örökmérlege 10 győzelem, 3 döntetlen, 1 vereség. Az egyetlen magyar győzelmet a zágrábiak ellen az UEFA égisze alatt rendezett kupasorozatokban 1997 őszén az MTK aratta. A Garami József irányította fővárosi kék-fehérek az orosz Alanyija Vlagyikavkaz elleni sikerrel (3–0, 1–1) indították szereplésüket az UEFA-kupában, így kerültek az akkor Croatia Zagreb néven szereplő horvátok útjába.
Az első, Hungária körúti mérkőzés igen színvonalas találkozót és 1–0-s MTK-sikert hozott, a 81. percben Lőrincz Emil pazar fejesével alakult ki a végeredmény. A Dinamo (Croatia...) erejéről sok mindent elárul, hogy az 1998-as világbajnokságon bronzérmes horvát válogatott tagjai közül Drazen Lazic, Goran Juric, Dario Simic, Robert Prosinecki és Krunoslav Jurcic is pályára lépett az MTK stadionjában (Igor Cvitanovic meg azért nem lett bronzérmes, mert a vb előtt összekapott a horvát szövetségi kapitány Miroslav Blazeviccsel). A visszavágót a horvát labdarúgás egyik zsenije, Robert Prosinecki döntötte el duplájával, a zágrábiak 2–0-ra nyertek és 2–1-es összesítéssel léptek tovább, hogy a nyolcaddöntőben az Atlético Madrid állítsa meg őket.
A DINAMO ZAGREB PÁRHARCAI MAGYAR CSAPATOK ELLEN AZ EURÓPAI KUPÁKBAN
1962–1963, VVK, elődöntő. Ferencváros–Dinamo Zagreb 0:1 (o), 1:2 (i), összesítésben 1:3
1997–1998, UEFA-kupa, 2. forduló. MTK–Croatia 1–0 (o), 0–2 (i), összesítésben 1–2
1999–2000, Bajnokok Ligája, 3. selejtezőkör. MTK–Croatia 0–0 (i), 0–2 (o), összesítésben 0–2
2002–2003, UEFA-kupa, 1. forduló. ZTE–Dinamo Zagreb 0–6 (i), 1–3 (o), összesítésben 1–9
2003–2004, UEFA-kupa, 1. forduló. MTK–Dinamo Zagreb 1–3 (i), 0–0 (o), összesítésben 1–3
2010–2011, Európa-liga, playoff. Győri ETO FC–Dinamo Zagreb 0–2 (o), 1–2 (i), összesítésben 1–4
2019–2020, Bajnokok Ligája, selejtező, 3. selejtezőkör. Ferencváros–Dinamo Zagreb 1–1 (i), 0–4 (o), összesítésben 1–5