A 2002-es világbajnokról azt írta a helyi média, hogy kapcsolatban állt a spanyolországi doppingbotrány központi figurájának tartott dr. Eufemiano Fuentesszel, s emiatt a klub menesztette.
"Kártérítést követelek. Azt soha sem titkoltam, hogy amikor Spanyolországba érkeztem, Fuentes sokat segített. De ennyi... Az elmúlt években nem találkoztunk, nem beszélhettünk, és ami fontos, nem doppingoltam" - mondta Botero, akinek a vádaskodás miatt ki kellett hagynia az idei Tour de France-t.