Isaac Cuenca a Barcelona első csapatában 2011 és 2014 között összesen 30 tétmérkőzésen szerepelt, ezeken a fellépésein négy gólt szerzett és 12 gólpasszt adott. Miután elhagyta a katalánokat, két spanyol csapat, a Deportivo La Coruna és a Granada mellett futballozott Törökországban (Bursaspor) és Izraelben (Hapoel Beer-Seva) is, majd idén januárban aláírt a japán élvonalbeli Szagan Toszuhoz, amelyben 29 bajnoki mérkőzésen hatszor volt eredményes.
Cuenca most egy másik japán csapathoz, a Vegalta Szendaihoz igazolt, amely a Szagan Toszut öt ponttal megelőzve a 11. helyen végzett a 2019-es japán bajnokságban.