A bukaresti születésű játékos a Dinamóban nevelkedett, és ott is mutatkozott be az élvonalban, majd két éve Kolozsvárra igazolt, ahol azonban keveset játszott. Az előző évadban a CFR az FC Voluntari-nak adta kölcsön, ahol édesapja, az 1998-as világbajnokságon is szereplő Liviu Ciobotariu az edző, így az éppen a Sepsi ellen 2–1-re elvesztett kupadöntőben is pályára lépett. A belső és szélső védőként egyaránt bevethető Denis Ciobotariu eddig 65 élvonalbeli mérkőzésen lépett pályára, és négy gólt szerzett.
Ciobotariu a Sepsi negyedik igazolása a nyáron, korábban három középpályás, Ion Gheorghe (Voluntari), Francisco Junior (Gaz Metan) és Cosmin Matei (Dinamo) érkezett, valamint a szentgyörgyiek végleg megszerezték a CFR-től az előző idényben kölcsönben szereplő balhátvédet, Rares Ispast is.