Marcio Amoroso 1992-ben a brazíliai Guaraninál kezdte profi pályafutását, majd megfordult Japánban, de aztán visszatért szülőhazájába.
Az 1996–97-es szezontól kezdődően három évadot húzott le az olasz Udinesében, kettőt az AC Parmában, 2001-től 2004-ig a Borussia Dortmund, a legutóbbi idényben a spanyol Malaga, legutóbb pedig a brazil Sao Paulo szolgálatában állt.