A 3. fordulóban már az NB I-es és az NB II-es csapatok is csatlakoztak a sorozathoz, de az élvonalbeliek nem kerülhettek össze egymással. Ha két csapat között osztálykülönbség van, az alacsonyabb osztályú a pályaválasztó. Ha a két csapat azonos osztályban szerepel, az játszhat otthon, amelyik a korábbi fordulókban kevesebbszer volt pályaválasztó. Amennyiben így sem dönthető el a pályaválasztás, akkor a sorsoláson elsőnek kihúzott csapat a pályaválasztó.
A továbbjutás egy mérkőzésen dől el, ha a rendes játékidőben nem születik döntés, kétszer 15 perces hosszabbítás dönt, ám ha ez sem vezet eredményre, tizenegyespárbajban dől el a továbbjutó kiléte.
A döntőnek ezúttal is a Puskás Aréna ad otthont.
A forduló hivatalos játéknapja: 2023. szeptember 16.
MAGYAR KUPA
3. FORDULÓ
III. Kerületi TVE (NB III)–DVTK
ESMTK (NB III)–Fehérvár FC
Soroksár SC (NB II)–Kecskeméti TE
Cigánd (NB III)–ZTE FC
Gesztely FC (megyei I.)–MTK Budapest
PMFC (NB II)–Újpest FC
Nagyecsed RSE (megyei I.)–Ferencvárosi TC
FC Ajka (NB II)–Mezőkövesd Zsóry FC
Mosonmagyaróvár (NB II)–Puskás Akadémia
BKV Előre (NB III)–Paksi FC
Pilisi LK (megyei I.)–Kisvárda
Eger SE (NB III)–DVSC
Budaörs (NB III)–BFC Siófok (NB II)
Dorogi FC (NB III)–Budapest Honvéd (NB II)
Bajai LC (megyei I.)–Szeged-Csanád GA (NB II)
Gödöllői SK (megyei I.)–FC Dunaföldvár (NB III)
Körösladányi MSK (NB III)–Gyirmót FC Győr (NB II)
Zsámbéki SK (megyei I.)–ETO FC Győr (NB II)
Szentlőrinc SE (NB III)–BVSC-Zugló (NB II)
Unione FC (BLSZ I.)–Csepel UFC (BLSZ I.)
Termálfürdő Tiszaújváros (NB III)–Nyíregyháza Spartacus FC (NB II)
Putnok FC (NB III)–Budafoki MTE (NB II)
Aqvital FC Csákvár (NB II)–Szombathelyi Haladás (NB II)
DEAC (NB III)–HR-Rent-Kozármisleny (NB II)
Tatabánya (NB III)–Szombathelyi MÁV Haladás VSE (NB III)
Bicskei TC (NB III)–Tiszakécskei LC (NB II)
Mezőörs KSE (megyei I.)–FC Nagykanizsa (NB III)
Békéscsaba 1912 Előre (NB III)–Kolorcity Kazincbarcika (NB II)
VLS Veszprém (NB III)–Komárom VSE (NB III)
Dunaharaszti MTK (megyei I.)–Vasas FC (NB II)
Kaposvári Rákóczi FC (NB III)–PTE-PEAC (NB III)
Kelen SC (NB III)–Majos (NB III)