A Bajnokok Ligája-küzdelmek lebonyolítását erre az idényre átalakította az Európai Kézilabda-szövetség (EHF), amely igyekszik követni a labdarúgásban látott és anyagilag, valamint szakmailag egyaránt bevált példát. A főtáblán a férfiaknál a 32 csapat nyolc, a nőknél a 16 együttes négy csoportban küzd a középdöntőbe jutásért. A főtábla csoportjaiból továbbjutó első és második helyezett együttesek a középdöntő négycsapatos csoportjaiba kerülnek.
A férfiaknál a középdöntőben a 16 gárda négy csoportban szerepel, és az élen végzők jutnak az elődöntőbe. A nőknél a nyolc csapat két négyes csoportra oszlik, és az első, valamint a második helyezettek küzdenek az elődöntőben.
A férfiaknál selejtező párharcokat rendeztek a 32-be jutásért, ám ezekben a kiemelt magyar gárdák nem voltak érdekeltek. A csoportok sorsolásakor a szegedieket az első kalapból (Kiel, Ciudad Real, Celje, US Ivry, Gudme, Csehovszki Medvegyi, RK CO Zagreb), a veszprémieket a másodikból (Pamplona, Hamburg, Velenje, Montpellier, D. Asztrahán, León, Flensburg) húzták ki.
A férfiselejtezőket szeptember 1–9. között játszották, a csoportküzdelmek hat fordulója szeptember 26-tól november 25-ig tart. A középdöntő csoportmeccsei február 6-án kezdődnek, és március 16-án zárulnak. A nőknél szeptemberben az előselejtezőket (nyolc csapat, két csoport, négy továbbjutó) már megrendezték, a Győri Audi szereplésével pedig pénteken megkezdődnek a tornarendszerű selejtezők (16 csapat, négy csoport, négy továbbjutó). A három mérkőzésen hazai pályán szereplő győrieknek az 1. selejtezőcsoportban a francia Metz, a szlovák Mihalovce és az előselejtezőből továbbjutó izlandi Stjarnan lesz az ellenfele. Ha továbbjutnak Konkoly Csaba edző játékosai, akkor a BL-főtáblán az A-csoportban a címvédő dán Slagelsével, a spanyol Ribarrojával és a Veszprémből távozó Zdravko Zovko edző új horvát együttesével, a Koprivnicával találkoznak.
A Budapest Bank-FTC kiemeltként – a Slagelse, a Viborg, a Krim Ljubljana, a Zvezda Zvenyigorod, a Kometal Szkopje, a Ribarroja, a Larvik, a Podgorica, a Koprivnica és a Nürnberg társaságában – került a főtáblára. Zsiga Gyula csapata a D-csoportban a nyáron megerősödő Viborggal, a Podgoricával és várhatóan a Valceával, a végső BL-diadalra is esélyesnek tartott román bajnokkal csap öszsze. A női főtáblán a csoportküzdelmek hat fordulója október 24-től január 13-ig tart, majd a középdöntő következik (február 6.–március 16.).