Bakker 2016 óta a holland klubnál már csak tanácsadóként tevékenykedett, de előtte több szakosztály elnöke is volt. Néhány hete még élőben tekintette meg a Vitesse FC Twente elleni bajnokiját. A sportvezető súlyos betegséggel küzdött, korábban tüdőrákot diagnosztizáltak nála, ám állapota azt követően romlott drasztikusan, hogy szombaton kórházba szállították, ahol kiderült, hogy megfertőződött a koronavírussal.
A holland média egybehangzóan megerősítette a halálhírét. A beszámolók szerint Kees Bakker szerda reggel hunyt el.