Marcelino a 2007–2008-as idényben már ült a Santander kispadján, akkor a Primera División-rekordot jelentő hatodik helyen végzett a csapattal a spanyol élvonalban, és ezzel kivívta az UEFA-kupa indulás jogát is.
A 45 éves szakember korábban a Zaragozánál, a Recreativo Huelvánál és a Sporting Gijónnál is dolgozott.