Rafinha a Barcelona akadémiáján nevelkedett, a katalánok B-csapatában 2011-ben mutatkozott be, majd a felnőttek között is debütált 2011 novemberében, a L'Hospitalet elleni Király-kupa-mérkőzésen.
Az elmúlt másfél szezonban 84 bajnokin lépett pályára a Barcelona második együttesében, és 20 gólt szerzett. A brazil-spanyol kettős állampolgárságú középpályás 2016-ig meghosszabbította a szerződését a Barcával.