Morales 2010 és 2012 között szerepelt a Ferencvárosban az Estudiantes kölcsönjátékosaként. Az első idényében alapemberré tudott válni a zöld-fehéreknél, ekkor még az is szóba került, hogy végleg megvásárolják őt, de erre nem került sor, ebben alighanem egymillió euróra taksált kivásárlási ára is szerepet játszott. A második magyarországi szezonjában már kevesebbet játszott, végül visszatért Argentínába.
Legutóbb a másodosztályú, 14. helyen záró Boca Unidos játékosa volt, amelynek színeiben két meccsen játszott, gólt nem szerzett. Moralesnek most lejárt a szerződése, így szabadon igazolható.