Az olasz szakember 2016 nyarán vette át a Bayern irányítását Pep Guardiolától, s bár első évében bajnoki címet, valamint Szuperkupa-győzelmet ünnepelhetett, a következő idény első súlyosabb veresége, a PSG elleni 0–3 az állásába került: a hírek szerint több játékos is megkérdőjelezte Ancelotti döntéseit a taktikát és az összeállítást illetően, és mindez a háromgólos vereség után csúcsosodott ki.
„Emlékszem, sírtam, amikor közöltem a döntést Carlo Ancelottival – mondta Ancelotti kirúgásáról Karl-Heinz Rummenigge a La Gazzetta dello Sportnak. – Carlo megértette a helyzetet, megölelt, s mindössze annyit mondott: »Habár nem vagy a főnököm többé, attól még barátok vagyunk«”.
„Nagyszerű ember és edző, a második idényében sajnos nem úgy alakultak az eredmények, ahogyan szerettük volna. Hihetetlenül nyugodt és barátságos személy, még a legnehezebb helyzetekben is. Talán várnunk kellett volna az elengedésével.”