Pepét a Németország elleni mérkőzés 37. percében állította ki a játékvezető, amikor megfejelte a végül három gólig jutó Thomas Müllert, a németek pedig 4–0-ra kiütötték a portugálokat. A találkozó után rengeteg bírálat érte a sokadszorra fegyelmezetlen hátvédet, akit korábbi trénere, José Mourinho is éles szavakkal kritizált brazil származását is felemlegetve.
„A tény, hogy Pepe valójában nem portugál, azt jelenti, hogy még inkább a megfelelésre kellene törekednie… De ennek nincs nyoma rajta” – reagált a történtekre a portugál szakember, akinek kapcsolata nem volt feszültségektől mentes Pepével Madridban.